
2023年9月26日,宁夏大学刘敦华教授团队在Food Chemistry(IF=8.8)上发表题为“TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration”的研究文章。研究人员利用TMT定量蛋白质组学共鉴定出377个差异表达蛋白(DEPs)。转铁蛋白、铁蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX) 4和血红素加氧酶1等15种DEPs参与脂质过氧化、Fe2+ 和Fe3+ 转化、铁离子积累和线粒体氧化应激诱导铁死亡。此外,化学致癌物ROS、谷胱甘肽代谢、HIF-1和PPAR等信号通路可能通过影响游离铁过载和GPX4失活来促进铁凋亡。该研究成果中 拜谱微生物 为其提供 TMT蛋清组学 的检测与分析,发现的差异蛋白有助于拓展屠宰后牛肉储存过程中铁死亡的生理和分子机制的认识。
PART 01
钻研结局
深入分析相关人员研究随食品食品冷藏耗时提升牛羊肉的氏光洁度、持水实力、光色、解离铁纯度、ROS、脂质过被金属氧化物、MDA、GSH和GPX4技术水平来分析相关肌肉策划 生殖生殖细胞的铁意外死亡模式。后果显现,食品食品冷藏耗时提升后,牛羊肉的氏光洁度在第六天和第6天为取得性减少;持水实力减低;配色变深,失亮泽,鲜朱桔红色化为暗朱桔红色。不仅,解离铁、可溶性氧和MDA的纯度为取得性添加,生殖生殖细胞凋亡率为取得性增加。 的研究人数转化成区别要在冷藏室保存时长的肌肤印刷品的血清质,然而确定SDS-PAGE概述,血清质条带在区别时代分散粗糙且相近(图1a)。表明血清在区别印刷品中的表明时候,概述出现 某个组印刷品的中个数贴近于某个技术水平(图1b),反映肌肤印刷品血清质存在优质的组内相近性和组间不同性。 核营养素组学共技术认定出1996种核营养素。以B0为对比组,筛分B1、B2、B4和B6中的核球蛋清酶去不一致性表明深入阐述,共技术认定到37七个DEPs。将火山图可视化效果,并要根据FC > 1.2、FC < 0.86和P < 0.05两种标准深入阐述DEP。最后图甲1c-f图甲中,在B1/B0、B2/B0、B4/ B0和B6/B0中分刘海别技术认定出22、33、73和140个DEPs,这里面分刘海别上浮6、11、32和8八个,调整16、22、41和53个。聚类算法具体方法考评了区别冷藏库关键时期身体全身肌肉组识中核营养素的表明,最后显视身体全身肌肉核球蛋清酶表明不一致性由于店铺用时的多而多(图1g)。
图1| 有所差异冰箱日子的肩部肌肉样品管理蛋白酶质组学(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图2| 不一样的冷藏库时光的肌群样本差异化蛋白酶数据分析(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
表1 铁枯死核蛋白肽的PRM化学发光法阐述(表源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图3| 应用场景KEGG生物富集不同之处表述核蛋白的铁消亡工作机制(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 202
PART 02、拜谱总结
作者利用TMT定量蛋白质组学鉴定发现15个参与铁死亡调节的DEPs,包含铁离子运输、 Fe2+ 和 Fe3+转化、脂质氧化途径、氧化还原调节和含铁蛋白降解途径。铁死亡依赖于铁离子积累、GPX4失活和脂质过氧化。此外,通过对DEPs的蛋白质和途径相互作用分析,发现了37条代谢途径,通过调节细胞铁超载、细胞膜或细胞器膜脂质氧化和ROS积累来促进铁死亡。铁下垂机制的发现可能为提高牛肉冷藏品质的相关研究提供新的视角,可能有助于预测肉类的潜在质量和鉴定铁下垂的生物标志物。这一过程中拜谱微生物提供了TMT化学发光法蛋清质组学技術服务管理性,拜谱微生物已新企业产品开发完成任务并搭建了落实完善的转录组学、蛋清组学、新陈代谢组学甚至多个学合作企业产品技術服务管理性管理体系,欢迎致电咨询!
参考资料专著:Liu J, Liu D, Hu Z, Hu Y, Yu X. TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration. Food Chem. 2023 Sep 26. doi: 10.1016/j.foodchem.2023.137596.