
2024年9月由上海畜牧业大学时张万刚院士团队图片在期刊Journal of Agricultural and Food Chemistry发表题为“Exploring the Effects of S‑Nitrosylation on Caspase‑3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro”文章,研究发现了GSNO处理后caspase-3的活性显著降低(P < 0.05),并表现出剂量依赖性的抑制作用,其在半胱氨酸116、170、184、220和264位点被S-亚硝基化,进一步抑制了其对牛肉肌原纤维蛋白的蛋白水解能力。拜谱动物为该研究提供了亚硝基化装饰组学拜谱生物,助力发现目的蛋白上的亚硝基化修饰位点。
中文版问题:体外研究S-亚硝基化对牛肉Caspase-3修饰和肌原纤维降解的影响
中文核心期刊:Journal of Agricultural and Food Chemistry
2023年影响到系数:5.7
投稿时期:2024年9月
买家的单位:南京农业大学
探讨村料:蛋白
拜谱作为工艺:亚硝基化修饰组学
技巧途径:
一、科学研究結果
01.Caspase-3活性氧
当下尚不知晓NO对caspase-3的可抑自制用是不是也归因于NO介导的S-亚硝基化,不一氧化还原电位系数的GSNO是外源性NO供应商,以引导caspase-3的体内S-亚硝基化。报告表达,与不GSNO的组相信,100、200和400μM GSNO组的caspase-3几丁质酶偏态变低(图1),与事先报导同一。GSNO治理 变低caspase-3几丁质酶的暗藏主观原因仍尚需揭示。
图1 有差异氨水浓度的GSNO加工处理对caspase-3活性酶类的影响到
02.Caspase-3的S-亚硝基化情况
探索世界Caspase-3的亚硝基化程度上较,以体现了GSNO对Caspase-3的不良反应性。经GSNO处置后,加测到caspase-3蛋白质S-亚硝基化的强度加入(图2)。等等既使说明,外源性GSNO致力于可实现目标诱惑caspase-3的身体外S-亚硝基化。更让人目瞪口呆的是,在如果没有GSNO有着的对比组中加测到两个忽闪的S-亚硝基化带,这说明caspase-3或许的发生内源性的S-亚硝基化。还有,本探索世界中caspase-3的S-亚硝基化程度上较较高,而caspase-3的生物有效降低,这与很久的探索世界同一。既使,caspase-3的特男人S-亚硝基化装饰位点尚不知道,还必须进三步的探索世界。
图2 GSNO除理对caspase-3S-亚硝基化技术的后果
03.Caspase-3的S-亚硝基化位点
通过亚硝基化突显组学检测caspase-3的S-亚硝基化位点。结果表明,caspase-3上的4个多肽中有5个半胱氨酸残基被蛋白S-亚硝基化修饰(图3)。亚硝基化半胱氨酸定位于SSFVCVLLSHGEEGIIFGTNGPVDLK,GTELDCGIETDSGVDDDMACHKIPVEADFLYAYSTAPGYYSWR,DGSWFIQSLCAMLK和KQIPCIVSMLTK的多肽中,分别位于116、170、184、220和264位。S-亚硝基化caspase-3多肽的MS1和MS2光谱显示Caspase-3是一种具有8个半胱氨酸残基的半胱氨酸蛋白酶,其中5个半胱氨酸被发现被亚硝基化,说明Caspase-3易受亚硝基化修饰(图4)。此外,据先前报道casase-3的催化残留亚硝基化Cys163,这不同于本研究的结果。S-亚硝基化caspase-3的丰度、位点的修饰水平和检测方法的灵敏度的差异可能是导致结果不一致的原因之一。可以推断,半胱氨酸蛋白酶活性的调节可能是由NO和蛋白S-亚硝基化介导的,这可能影响蛋白降解,促进死后衰老。
图 3 caspase-3的编码字段。紫色标识的编码字段提出法S-亚硝基化肽,红颜色标识的C提出法S-亚硝基化半胱氨酸
图4. s-亚硝基化肽和caspase-3位点的MS1和MS2光谱图
04.S-亚硝基化Caspase-3吸附结球蛋白
结血清是 属于最重要的的人体细胞膜骨架血清,在恢复肌人体细胞膜组成部分的组成部分完美性和伸缩性方向起着最重要的功能,理论研究S-亚硝基化caspase-3对结血清吸附的太敏主观极具最重要的意议。与Std(未用胱天血清酶-3和GSNO孵育的一开始肌黏胶食物纤维血清)组对比,0 μM GSNO组(肌原黏胶食物纤维和caspase-3的孵育,无GSNO)的完美结血清含铁相关系数降低了,温馨提示caspase-3对结血清极具不确定的血清电离程度。在GSNO孵育后,完美结血清的含铁特别增添(P < 0.05)。于此,当GSNO氨水浓度提高时,完美结血清的含铁快速调整(P < 0.05)(图5)。这样发掘表示,SNO绘制的caspase-3以能力信任的的方法抑制性结血清的吸附。
图5.S-亚硝基化caspase-3分解结蛋清
05.S-亚硝基化Caspase- 3挥发肌钙核蛋白-T
肌钙蛋清-T (TnT)是原肌球蛋清也可以调低担负胸肌弯曲的细条的有必要肌原合成棉纤维素蛋清。TnT的生物溶解塑料塑料本质特征是查测到28和30 kDa的TnT。在亚硝基化条件下,caspase-3对TnT的生物溶解塑料塑料症状就像文中6如下,与Std组(没含caspase-3和GSNO的肌原合成棉纤维素)比较,caspase-3组中30 kDa TnT片断差异化性不断增加,证实caspase-3进行了TnT的生物溶解塑料塑料,不但,caspase-3与GSNO的孵育以至于30 kDa TnT减退。在100和200 μM GSNO组相互不存在查测到清晰的差异化(P > 0.05),而当GSNO的溶度起到400 μM 时,该片断差异化性避免(P < 0.05)。以下找到证实了SNO突显的caspase-3对TnT生物溶解塑料塑料的遏开发用。结蛋清和TnT是caspase-3的过敏底物,而GSNO解决调低caspase-3的生物会以至于肌原合成棉纤维素蛋清生物溶解塑料塑料因素调低。以上所讲,NO诱发的S-亚硝基化也可以用突显半胱氨酸残基来也可以调低caspase-3的生物,从根本上进一点后果其对结蛋清和TnT的蛋清电离效率,而使后果鸡肉品味。
图6. S-亚硝基化caspase- 3可降解肌钙球蛋白-T
二、个人心得体会
本学习亟需试论S-亚硝基化对caspase-3遮盖的印象十分己经对羊肉肌原化学钎维体内分解的印象。蛋清S-亚硝基化能能遮盖caspase-3的半胱氨酸残基,而使使得caspase-3渗透性降低了,进一部遏制了其对羊肉肌原化学钎维蛋清的蛋清蛋白质水解效率。三、拜谱个人心得体会
研发按照了酶活测试,亚硝基化表达组学介绍,WB等测试方法手段,看见血清质S-亚硝基化可能表达caspase-3的半胱氨酸残基,这使得了caspase-3抗逆性的调低,并举一大步抑止了其对鸡肉肌原玻璃纤维血清质的血清质水解反应力量。本研发为表述血清质质亚硝基化对口感的监测考核机制打造了个新的视野。拜谱生物作为一家国内领先的多组学服务公司,可提供完善成熟的核氨基酸组学、遮盖核氨基酸组学、代谢转化组学、转录组学等多组学产品技术服务体系,整合多组学数据进行深入挖掘分析,全面解析机制机理等,助力高分文章发表。除此之外,拜谱生物还可提供半胱氨酸类型商品,包括亚硝基化、谷胱甘肽化、硫巯基化、次磺过酸、total空气氧化展现、悬浮巯基,欢迎大家咨询!
选取学术论文:
Qin Hou, Chao Ma, Rui Liu, Zhuangli Kang, and Wangang Zhang.Exploring the Effects of S-Nitrosylation on Caspase-3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro. Journal of Agricultural and Food Chemistry. doi.org/10.1021/acs.jafc.4c06663