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HEATag:单细胞测序样本标记新方法,低成本、跨物种、全平台兼容!

发布时间:2025-11-10

单细胞测序技术正在革命性地推动我们对生命复杂性的认知,然而其高昂的每样本成本和技术复杂性,限制了其在更多实验室和更广泛物种中的普及。尽管多重样本标记技术能有效“降本增效”,但现有的方法往往受限于免疫抗体外来物种特女性朋友、寡核苷酸装饰资金高额或使用环节繁杂。近日,南方海洋科学与工程广东实验室(广州)的陈凯教学开发团队在Journal of Genetics and Genomics上发表了一项创新性方法学研究,提出了一种名为HEATag的新型样本标记策略,为我们提供了一个低总成本、跨种群、全软件平台兼容的全新解决方案。

中文核心期刊详细资料

Journal of Genetics and Genomics (JGG)是由国家完美院基因基因遗传规律规律的基因与发育状况菌物工程学分析所和国家基因基因遗传规律规律的基因自学主办单位的國际学界界论文论文杂志,专业专注于消息生命是什么完美和医美基因基因遗传规律规律的基因学业务行业这个领域的原创内容性分析成效。JGG 2025年度应响指数公式7.1,Scopus学界界论文论文杂志评介指标值CiteScore 9.9,排第JCR 2025年度GENETICS & HEREDITY业务行业这个领域Q1区(Top 10%),BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY业务行业这个领域Q1区,排第国家完美院论文论文杂志设计布局菌物工程学个类别1区(Top论文论文杂志),基因基因遗传规律规律的基因学和生物技术化与分子结构菌物工程学小类双1区。

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这些是HEATag

委婉的“二一体化”装修设计

HEATag是由凝集素和HUH内切酶构造的溶合核蛋白

「精准定位器」接口 - 凝集素

能够识别细胞膜上广泛存在且高度保守的糖基化呈现(如GlcNAc和Neu5Ac)。

「衔接器」模块图片 - HUH内切酶

可以序列特异性地与普通的、无需化学修饰的单链DNA(ssDNA)字段长条码做出共价接入。

“1+1>2”的视觉效果:将两者融合,得到的HEATag蛋白既能通过凝集素牢牢锚定在细胞膜上,又能通过HUH蛋白携带特定的DNA条形码进行样表标注与追溯。

Fig1: HEATag重量标上作用图示图

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实践抽样检查

HEATag又有多用打?

可不可以在各个具体条件下,确保蒲乳期软体动物神经血细胞系单神经血细胞混样测序

实验室里的设计再精妙,也要经过真实样本的 “实战考验” 才算数。科研专业团体为 HEATag 設置了多轮 “压强测试方法”,从组织组织细胞系到组织组织细胞结构,从底温到底温,从新鲜样板到确定样板,全八卦方位校验它的平稳性和可信性。

第1 轮測試重要性哺乳期间哺乳动物生殖肿瘤細胞系:设计工作人员挑选了出自于人、鼠、仓鼠三大植物动物群的4种生殖肿瘤細胞(HEK293T、K562、MEF、CHO),在常温下要 HEATag 标示后分层测序。既定的回收利用的 11447 个生殖肿瘤細胞中,85.66% 都能凭借 HEATag 条型码确切相配到原植物动物群,样本量间相互污染问题极低,UMAP 聚类介绍法介绍更加随便证明信,HEATag 条型码与植物动物群特男人dna组的特征极高一直。 紧接着,测试测试经济状态进几步强制升级:研究方案考生成功在 4℃下标出符号新鲜度毛肚体内部膜、在环境温度下标出符号甲醇稳固体内部膜,也马上标出符号体内部膜核。然而已然全场最佳:全部的经济状态下,样品量价签与种类企业信息均具备着极好的对应性,拆成精准率超 95%。就算甲醇稳固会促使一些的转录本交叉点被污染,体内部膜核配制会产生一些 RNA 离职,体内部膜类型的的参考文献标注然而已然与新鲜度毛肚样品量控制一致性,证明怎么写 HEATag 行标出符号不相同治理 经济状态下的实践样品量。

Fig2: HEATag 可在有差异标准下进行单血细胞转录组混样讲解

还可以标记图片辅乳期动植物和海洋生物无脊柱动植物的原代肿瘤细胞

如果你说人体内部系测量是 “知识基础题”,那团队范例也就是 “额外题”, 某些范例经常因人体内部类形较为复杂、区域环境改变性特殊的,为标出高技术的 “重瓶颈问题”,而 HEATag 正好在某些 “重瓶颈问题” 上出现了优点。

研究团队选择了大鼠和小鼠的睾丸团队,这类样本包含精原干细胞、精母细胞、精子细胞等多种类型,对标记一致性的要求极高。实验中,两种动物的睾丸用特异性 HEATag 条形码标记后混合测序,最终获得的 14663 个细胞这样不仅能被最准确分别,任何关键神经元方式的聚类算法最终都明了可辨。

更令人惊喜的是HEATag对海洋能海洋生物的兼容性测试性。HEATag能在海水的等渗溶液中标记新鲜的海洋动物细胞(如海月水母、大西洋海刺水母)。研究人员用人工海水稀释的HEATag 标记了水母和珊瑚的组织细胞后在 BD Rhapsody 平台测序,最终回收的 6452 个细胞中,HEATag 长形码与动物群转录组具较高同步性,就没有现身因高盐工作环境影响的 “标注就失效”。后续对甲醇固定的海洋生物细胞测试结果显示,HEATag 在固定样本中的拆分效果优于新鲜样本。

Fig3: HEATag 可变现哺乳期间绿色团体子样本众多 scRNA-seq 分享

Fig4: HEATag可满足最新鲜海洋能无脊椎骨节肢动物重量 scRNA-seq 解析

HEATag与细胞系的整合不想所致转录组的特殊改进

对样本标记技术来说,“不影响样本本身的 RNA 特征” 是底线。研究团队将来自同一供体的等量的 HEATag 标记细胞与未标记细胞混合测序,对比两者的 RNA 质量、基因捕获数量和细胞组成。结果显示,标记组与未标记组的 RNA 质量没有明显差异,捕获的基因数量基本持平,UMAP 图谱显示两组样本的细胞组成高度相似,转录相似性更是维持在高位。无论是细胞簇的注释结果,还是不同细胞类型的基因回收数量,两组都几乎一致,没有出现 “标记导致的基因表达异常”。这意味着,HEATag在做好记号工作的此外,也不会对后继的转录多组分析引致侵扰,担保了研究分析的数据的实际性。

Fig5: HEATag不可能关系样本量的 RNA 表达方法经济模式

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素可期

HEATag 能为单组织细胞深入分析面临那些?

HEATag 的使用价值,远不是只有于 “完成标记符号困难”,它的协调性性和共通性,真正为单细胞膜研究分析拉开更高会性

从APP情境看看

HEATag 能包裹从 “容易相对较了解”(如癌聚集与普通 聚集、药办理与對照)到 “新一波性研发”(如聚集生殖细胞核图谱制作、高通骁龙量筛分)的全范围内消费需求。跟着 PIP-seq、Stereo-cell 等最新科技可寻址技术水平的发展进步,HEATag 还能进的一步增强单生殖细胞核研发的通量,转向科学管理团队抓好更新一波性的項目。

从跨研究方向竟争力来瞧

HEATag 不光支持于转录组学,还能与表观dna组学、核核苷酸组学、房间组学等能力工艺搭配,经过环保定制家具引索和寡核苷酸回文序列,HEATag 可更好靠拢不一的组学步骤流程,不决定的信号捉捕厚度。时候,应用于HEATag还可的发展单生殖细胞糖组学理论研究能力工艺。

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合作关系动态展示

拜谱动物与陈凯教受完成过程联合意向但这并

值得购买目光的是,在 HEATag 新技术性性展现什么出极大使用发展空间的原型下,拜谱海洋能生物体已与华南地区海域合理与项目 杭州科学试验室(珠海)陈凯教导制定目标最初达成合作购房意向。甲乙双方行动计划包围 HEATag 新技术性性的产业发展化趴地、科技研发生成等目标方向刺激性深度.优势互补,深入推进某一低资金、跨鱼类的单受损細胞标出新技术性性迅速使用于其实科技研发游戏场景,为较多科学试验室展示有效率、经济社会的单受损細胞研发产品,推助科技研发工作中者在受损細胞海洋能生物体学、海域海洋能生物体学、急病长效机制等领域行业达成较多翻过
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