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首页 > 拜谱生物 > 干货分享 > 线上药理学学阐释草酸钙肾结石硫化应激性和细菌感染伤害制度化

网络药理学揭示草酸钙肾结石氧化应激和炎症损伤机制

发布时间:2024-08-02
草酸钙(CaOx)肾结石是泌尿控制程序最喜欢见的患病之四。肾聚集中CaOx结晶过饱合沉积状会导至肾小管体细胞损害和凋亡,得以导至肾结石的导致。短链皮下脂肪含量酸由肠内内厌氧食物发酵微生物食物发酵营养健康纤维材料制造,不禁在位置肠内第一道防线中推动功用,又很在控制程序层次上也推动关键因素功用。里面,丁酸是最极为丰富的短链皮下脂肪含量酸,有消除炎症和免疫力调控功用,本研发浅谈丁酸对CaOx肾结石的功用还有其未知靶点。

围绕草酸钙肾结石相关机制研究,华山医院医生泌尿产科吴忠院士、周子健博士后于今年5月在Chem Biol Interact发表了相关成果,7月4日该团队又有一篇新作发表。吴忠老师、周子健医学博士在Food and Chemical Toxicology(IF=4.3)上发表题为“Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9”的研究文章。研究人员发现丁酸在体外和体内均能抑制CaOx肾结石模型的氧化应激和炎症损伤,并利用网络药理学预测发现CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的靶基因,最后通过细胞实验证实CYP2C9在草酸诱导的HK-2细胞损伤模型中的作用。拜谱动物与吴忠教授、周子健博士团队再次合作,提供了网站药学学工作,助力预测CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的潜在靶点,为丁酸预防CaOx肾结石产生的临床应用奠定理论基础。

的文章简称:Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9(Food Chem Toxicol.,IF=4.3,2023.07) 合作方企业单位:华山医院口腔科 研究分析喜欢的人:大鼠、HK-2组织 好友分组讯息:较组(Con)、模型工具组(Model)和丁酸钠组(NaB) 拜谱展示 的技术:在线药学学监测

总体目标流量图

学习然而

钻研方案人工首要建设大鼠三维实体整治,在生理上生物化因素和团队方面的问题学脱色等钻研方案方式方法找到丁酸都可以少CaOx三维实体整治大鼠肾CaOx氯化钠晶体的产生和受伤,提高CaOx三维实体整治大鼠的宫颈炎症受伤和空气氧化的化学物质的优化传达。还有,丁酸还可有抑制草酸帮助的HK-2神经元受伤、空气氧化的应激状态和神经元凋亡。 为探讨丁酸空间设备构造和靶DNAwifi数据微信互联网,探讨人工从PubChem了解丁酸和丁酸酯的二维和三维立体空间设备构造(图1A)。顺利通过PharmMapper数据文件信息报告库和Uniprot数据文件信息报告库补救后共筛分出1115个丁酸靶DNA供进一部定性探讨。将DNA全部拷贝到STRING数据文件信息报告库,确定PPIwifi数据微信互联网定性探讨。Cytoscape提供了排列的前20的核心靶DNA的详细了解wifi数据微信互联网图,包扩CYP2C9、CASP3、MAPK14、ALB、HRAS、ABL、RARA、RARG、RXRB、PRKACA、NOS3、SRC、MMP9、KDR、HSP90AA1、HPGDS、GSTA3、GSTA1、GSR和GSTM2(图1B)。这么多核心DNA与wifi数据微信互联网中的任何DNA均具体表现出千万的一些联性,说明书这么多DNA可以展现着协同管理使用。GO和KEGG定性探讨论述了丁酸核心DNA的一些联路线和怪物学的功能(图1C)。核心DNA基本与类固醇激素药类对答、腐蚀应激化学反应状态对答、可溶性酶氧人体细胞对类固醇激素药类刺击的的症状各种对呈酸性物理化学的物质的的症状光于。以上阐明,这么多核心DNA基本直接参与了腐蚀应激化学反应状态和对可溶性酶氧的怪物的症状流程,是肾结石构成考核机制中至关核心的路线,这表示丁酸可以在肾结石中展现核心使用。

图1| 丁酸组成部分与靶DNA网咯具体分析(图源:Zijian Zhou., et al., Food Chem Toxicol.

为进这一步宇宙探索丁酸对CaOx肾结石确实切靶染色体遗传,调查解析员工运用GEO大信息表对GSE73680中健康生活比与CaOx肾结石病员的染色体遗传差别做出了调查解析。比组与CaOx结石病员的重要力差别形容方法爱染色体遗传(DEGs)表观遗传检测条件为P < 0.05、|log2(FC)| > 1。共挑选到3783个染色体遗传发生的重要变动,中仅3379个(89.4%)染色体遗传形容方法爱上涨,404个(10.6%)染色体遗传形容方法爱下跌(图2A)。对DEGs做出聚类分析解析法解析,热图体现 了前10个被选中DEGs的二维逐层聚类分析解析法特征描述(图2B)。随后不久,调查解析员工完成GeneCards大信息表人为鉴定结论了370个有机会与CaOx肾结石相应的的染色体遗传,排明前20位的预估染色体遗传以及其相应的性打分如图是2C图示。要为搜到丁酸调理CaOx肾结石的关键点靶点,调查解析员工将PharmMapper中的丁酸靶点、GEO中的DEGs和GeneCards中的CaOx肾结石相应的染色体遗传补救赢得一个多个Venn图。从而,CYP2C9被明确为丁酸导致CaOx肾结石的潜在性靶点(图2D)。前者,调查解析员工还做出了丁酸与CYP2C9的大分子接管,CYP2C9的几个核苷酸残基ASN-474、LYS-48和GLY-46与丁酸充分的作用,氢键能为4.2 kcal/mol(图2E)。 在灵活运用网格临床药理学分析CYP2C9是丁酸影响力CaOx肾结石的靶基因遗传后,学习考生还经由血神经细胞科学实验查证了CYP2C9可下降草酸引导的HK-2血神经细胞的ROS含量、支原体感染破损和凋亡。

图2| 而言据库协同介绍預测CYP2C9是丁酸目的于CaOx肾结石的靶人类基因

深入分析但是

本研究探讨第一方面感觉丁酸在身体外和内部均能压制CaOx肾结石型号的阳极防氧化应激反应性和真菌感染损坏,随即经由系统临床药剂学学挑选拥有丁酸作用CaOx肾结石的因素靶点——CYP2C9,另外经由神经细胞核实验设计印证CYP2C9在草酸盐引导的HK-2神经细胞核ROS品质、真菌感染损坏和凋亡。这感觉阐明丁酸可能经由压制CYP2C9来压制CaOx肾结石的阳极防氧化应激反应性,避免真菌感染损坏。这个方式中拜谱生物工艺体提供数据了系统临床药剂学学技艺安全服务于,凡此种种拜谱生物工艺体可升高成熟稳定改进的表观遗传组学、球营养素组学、排泄组学等两组学产品的及技艺安全服务于,追捧转达咨询公司! 可以参考论文:Zhou Z, Zhou X, Zhang Y, Yang Y, Wang L, Wu Z. Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9. Food Chem Toxicol. 2023 Aug. doi: 10.1016/j.fct.2023.113925.
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